LMI Adaptation des Plantes et microorganismes associés au Stress Environnementaux

Le LMI Adaptation des Plantes et microorganismes associés aux Stress Environnementaux (LAPSE) propose l'accès à des outils et expertises pour la caractérisation de la biodiversité et la génétique moléculaire végétale au travers de 2 sites: l'Unité de Recherche en Culture in vitro (URCI, Centre de Bel Air, Dakar) et le Centre d'Etude Régional de l'Amélioration de l'Adaptation à la Sécheresse (CERAAS, thiès).

URCI

Services proposés :

1. Génotypage
2. Etudes de biodiversité
3. Génétique des populations
4. Identification et clonage de gènes (mise en place)
5. Études d'expressions des gènes (mise en place)

Liste des équipements mis à disposition

1. Thermocycleur 96/384 puits
2. Station PCR (en cours )
3. Nanodrop (en cours)
4. équipement divers (centrifugeuses, pipettes multicanaux)

Coordinateur : Ndjido KANE

CERAAS

Services proposés :

1. Génotypage marqueurs microsatellites et AFLP
2. Analyse de la diversité génétique des plantes
3. Construction de cartes génétiques
4. Analyse génétique dans des populations en ségrégation
5. Sélection Assistée par Marqueurs

Liste des équipements mis à disposition

1) Poste extraction d’ADN:

• Une hotte extractice à deux places
• Une centrifugeuse réfrigérée Hettich Universal 320R + rotors 24 tubes et rotor à plaques
• 1 centrifugeuse 24 tubes Sigma et deux centrifugeuses 12 tubes Eppendorf
• Un lyophilisateur Christ ALPHA 2-4 LSC
• Un vibro-broyeur Retsch MM301
• Deux bain-marie dont 1 avec agitation
• Un spectrophotomètre

2) Poste PCR:

• 3 pipettes électroniques dont 2 monocanaux et une multicanale
• 5 thermocycleurs 96
• Une machine à Glace

3) Poste Migration

• Une Mupid
• Un système de photo-documentation
• Six systèmes d’électrophorèse horizontaux
• Deux systèmes d’électrophorèse verticaux
• Un séquenceur (analyseur de fragments) de type Licor modèle 4300

Coordinateur : Daniel FONCEKA

Modalités d’accès aux équipements des ateliers:

• Un entretien préalable avec les membres de la plateforme afin de définir le type d’appareil le plus approprié à votre problématique. Suite à l’entretien, les utilisateurs doivent remplir une « demande d’accès aux équipements » pour donner leurs accords quant à la prestation proposée et aux modalités d’accès proposées

• Une réservation obligatoire auprès du coordinateur de l’atelier ;

• Une utilisation des équipements assistée des ingénieurs et techniciens de la plateforme ;

• Une mise à disposition des équipements après formation par un membre de la plateforme ;

• Un engagement à respecter les règles d’hygiène et de sécurité et les consignes internes à la plateforme